麹菌は、室町時代の頃より日本全国に点在する種麹屋によって管理されてきた経緯がある。2006年、麹菌は「われわれの先達が長い間大切に育み、使ってきた貴重な財産」であるとして、日本醸造学会によって「国菌」に認定されている
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